Segunda hipótese 

3. º - o nome seria oriundo de um matadouro, que existia na Rua Santo Amaro.

Para o historiador Antonio Egidio Martins, em 1.773, foi feito de taipa de pilão "com toda a segurança" o matadouro "na Rua de Santo Amaro, nas imediações da Capela de Santa Cruz e Rua Jacareí..." (1) (2)

 Mais tarde, foi transferido para o final da hoje Rua Humaitá, junto ao Riacho Itororó (Av. 23 de Maio), no qual se vendiam ou davam bexigas de boi e de porco.

Já Afonso A. de Freitas dá a sua versão quanto ao nome do bairro. Para ele Bexiga viria de "bexiga de boi", que o dono da chácara venderia e que era, na época, um negocio bastante lucrativo. (5)

Segundo Nuto Santana, essa é uma hipótese que deve ser considerada, pois, o negócio de tripas foi bem explorado em São Paulo, existindo para sua venda, inclusive, umas carrocinhas, que percorriam as ruas “ao chouto de umas pilecas anciãs, enquanto o tropeiro (2) , no alto da boleia, soprava numa trombeta de chifre, com toda força dos bofes, umas notas em sustenido”.

Além disso o matadouro foi naquelas cercanias fronteiriço à chácara, que talvez tivesse dado nome ao bairro.

Terceira hipótese

2.º - o nome de família de  Antonio Bexiga, proprietário da estalagem do Bexiga ou de um seu ancestral, ter-se-ia transferido para a Chácara do Bexiga e, posteriormente, também para o antigo bairro do Bexiga e, em seguida, para o bairro formado pelos italianos em 1.878.

É interessante observar que Saint-Hilaire diz em 1.819:

"Existe em São Paulo uma ponte chamada Ponte do Bexiga e que talvez tenha o nome do hoteleiro ou de algum de seus predecessores"(3) .
Na descrição, refere-se nitidamente por duas vezes a "um honesto Bexiga", que ali vivia na ocasião.

 Por que, então, esse "algum de seus predecessores?".
Portanto, é de supor que - se até a ponte era conhecida como "Ponte do Bexiga" - com certeza essa região também teria o mesmo nome, oriundo do sobrenome de família "Bexiga".

Será que a alcunha passou de pai para filho ou o hoteleiro não deu o nome ao lugar e sim o lugar que lhe transmitiu o apelido? (4)

João Batista C. Aguirra, porém, afirma que  Antonio Bexiga, que lhe deu o nome ao bairro.

Consta inclusive que seu inventário se encontra em um dos cartórios de Santos.
A escritura de 30 de agosto de 1863 registra que Antônio José Dias Leite vendeu a Chácara para Thomaz Luiz Álvares.

Portanto, é de supor que Antônio Bexiga não era proprietário da Chácara, mas tão somente posseiro de parte do início da Chácara, que se iniciava nas margens do Ribeirão Anhangabaú e pertencia a Antônio José Dias Leite até 30 de agosto de 1863, quando então a vendeu para Thomaz Luiz Álvares.

Algum seu ancestral teria a posse do imóvel, onde construiu a estalagem do Bexiga, no mínimo desde do final do século 18. 
Daí, o nome Bexiga para a região ter aparecido em 1.793.

Conclui-se que o nome de família Bexiga deu nome ao bairro, mais tarde este nome se transferiu para a Chácara do Bexiga e, posteriormente, ao novo bairro do Bixiga. fundado em 1º de outubro de 1878.

Na "Reminiscência", de João Luiz Promessa, na relação dos sepultamentos na Igreja de Santo Antônio de Santos (Livro aberto a oito de janeiro de 1726), por Manuel Jerônimo de Oliveira (Ministro), o seguinte: “N. 15- Antônio Bexiga, falecido em São Paulo em 13 de junho de 1857”, deixando a quantia de 100$000 de esmola para a Ordem Terceira. (4).

Isto afasta a hipótese de que não se tratava de um apelido por ele residir em um antigo sitio de bexigosos ou ter sofrido da moléstia.

Bexiga era seu verdadeiro nome de família.

João B. C. Aguirra cita nomes, que poderiam ser ancestral do estalajadeiro Antônio Bexiga: Antonio Pereira Bexiga, também conhecido por Antonio Pereira Piques 

Segundo Nuto Santana, pelo recenseamento de 1.777, Antonio Pereira Piques estava, na época com 60 anos. Era casado com Joana Ignácia; viviam em companhia de uma liberta, chamada Íria, e de dois agregados, além de seis escravos. (5)

Mas, não resta dúvida de que, tomando por base o surgimento da denominação Bexiga (entre 1.789 e 1.792), podemos concluir que Antonio  Bexiga, o estalajadeiro, que hospedou Saint-Hilaire em 1819, não deu o nome ao bairro.

O mais provável é que teve origem no nome de seu pai ou avô, que tinham o mesmo nome de família: Bexiga.

É de se destacar que, quando uma determinada região ainda é muito pouco povoada, ou só uma pessoa a esteja ocupando, a referência a ela se faz pelo nome de seu proprietário ou de quem tenha a sua pose.
Um exemplo é a "Cachoeira dos pretos", que se encontra no município de Joanópolis no estado de São Paulo.
A proprietária do imóvel, onde se acha a cachoeira, tinha o sobrenome, de origem italiana: Pretti.
Aí de boca em boca, deixou de ser Cachoeira dos pretti e passou a ser conhecida como "Cachoeira dos pretos".

Em razão do nome ser bastante curioso e sem explicação conhecida, muitas lendas surgiram.

Uma, que os escravos fugidos se escondiam nas suas imediações, outra que os senhores, proprietários de escravos, costumavam jogar escravos rebeldes do alto da Cachoeira, para castigá-los e/ou servir exemplo para que outros escravos, para serem mais obedientes e menos rebeldes.

Outra ainda afirma que os negros, cansados da escravidão, pulavam do alto cachoeira para se suicidarem.

Imitavam Zumbi dos Palmares, que se suicidou, gritando: "Morrer mil vezes do que viver escravo"
Com o bairro do Bexiga, pode ter acontecido situação parecida.

O nome de família dos primeiros moradores era Bexiga.

Nome pouco comum e ainda lembrava bexiga de boi, que era vendida ou dada por um matadouro, que existia na atual Rua Humaitá.

Outra lenda ou hipótese, era a epidemia de varíola, que assolou São Paulo por muito tempo.

E muita gente passou a entender que o nome do bairro teria origem na epidemia.

As pessoas, acometidas da doença, ficavam com marcas semelhantes à bexiga em todo o corpo, inclusive no rosto.

Daí as lendas envolvendo o bairro, as quais teriam surgido em razão de nome de família pouco comum.